Le docteur Alphonse n'est pas un médecin ordinaire. Avec ses drôles d'instruments, il descend au fond de l'océan pour soigner les animaux malades : un hippocampe myope, un requin qui a mal aux dents ou encore une baleine qui n'a pas le moral. Mais quand Alphonse a des problèmes de sous-marin, ce sont tous ses nouveaux amis reconnaissants qui vont l'aider à se tirer d'affaire.