Tokyo est libérée suite à la mort d'Ami, mais un terrible message laissé par ce dernier est révélé par la dernière page du cahier de prédictions. Kenji doit à nouveau plonger dans le passé avec le simulateur de réalité virtuelle d'Ami-land pour découvrir ce dont il s'agit et sauver encore une fois l'humanité. Conclusion de la série avec une fin inédite qui reprend celle de l'adaptation en film.