Cette saga met en scène les élèves d'une école de magie dans un univers futuriste, dominé par les nouvelles technologies. En 2095, Tatsuya Shiba et sa jeune soeur Miyuki ont rejoint l'école. Alors que l'un est relégué au rang des élèves les moins doués, l'autre est vue comme un véritable prodige. Mais bientôt, des complots et des menaces se mettent en place.