Au coeur du XIIIe siècle, Jaufré, enfant abandonné devenu troubadour, revient dans la ville de Pamiers après sept ans d'absence. Il y retrouve sa nourrice Thomette, l'abbé Aymar qui l'a élevé, son demi-frère Alexis, le luthier, le bibliothécaire et d'autres habitants de la ville. Il fait alors des découvertes dont celle d'un manuscrit hérétique qui révèle les secrets bien gardés de l'Inquisition.