Depuis que leurs parents ont été assassinés pour avoir découvert un secret d'Etat, Ilsa, Mathilde, Emile et Zacharie n'ont plus d'existence légale et doivent changer d'identité. Ils sont aidés par l'énigmatique Nicolas Mandragore, ancien directeur de l'Institut médico-légal de Paris. Ensemble, ils cherchent à rétablir la vérité sur des affaires trop vite classées par les autorités.