Hugo Kezer et Anna Gilardi, les commandants en charge de la cellule Nouvelles menaces, se rendent à Nantes où les crues de la Loire prennent une ampleur inédite et coïncident avec une vague de suicides. Des malades atteints d'encéphalite fulgurante choisissent de se donner la mort. Secondés par le lieutenant Fabrice Le Troadec, Hugo et Anna enquêtent alors que la ville doit être évacuée.