A New Cherbourg, en pleine Belle Epoque, les frères Côme et Pacôme Glacère enquêtent sur le vol d'un dossier top secret survenu au service de contre-espionnage de la ville. Ils sont aidés par leur nouvelle recrue Julienne et son jeune frère, Gus, marchand d'oiseau. Au même moment, une créature sous-marine inconnue est retrouvée sur la plage. L'enquête se déroule dès lors sur terre et sous la mer.